粪便涂片镜检也是临床重要的常用检查，除可发现寄生虫卵、原虫、细菌外，还可观察不同结构的消化产物。
1、红细胞：见于下消化道出血、肠道炎症、肠结核、结肠肿瘤等。
2、白细胞：易在粘液中检出。若其形态破坏、结构模糊者则称为脓细胞。检出白细胞表示肠道有炎症，其数量多少一般可反映肠道炎症的程度。
3、巨噬细胞：由单核细胞而来，见于菌痢、溃疡性结肠炎。
4、肠粘膜上皮细胞：整个小肠、大肠(除直肠齿状线处外)粘膜的上皮细胞均为柱状上皮，生理情况下，少量脱落的柱状上皮细胞多已破坏，粪便中见不到。炎症时可增多而呈卵圆形或柱状，常夹杂在白细胞之间。
5、肿瘤细胞：取乙状结肠癌、直肠癌患者的血性粪便涂片、染色、镜检可能找到成堆的癌瘤细胞。
6、寄生虫卵：最常见者为蛔虫、钩虫、鞭虫及蛲虫卵等。如直接涂片不易查到时，改用集卵法可提高检出率。但蛲虫多在午夜移行到肛门及会阴产卵，粪检时我不易找到，故必须注意采样。
7、原虫类：如阿米巴、滴虫及梨形毛虫等。
8、食物残渣：如发现大量脂肪颗粒、肌肉纤维，多见于消化不良、胰腺炎患者。此外，梨形鞭毛虫病、胃泌素瘤也可引起脂肪泻。
9、结晶：在阿米巴痢疾或其它过敏性疾病后找到尖梭形结晶。
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